Γενετικής Πληθυσμών και Εξέλιξης
Στοιχεία Εργαστηρίου
Τίτλος Εργαστηρίου: Γενετικής Πληθυσμών και Εξέλιξης
Σχολή: Σχολή Επιστημών Υγείας
Τμήμα: Τμήμα Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής
Email: mgeorgit@mbg.duth.gr
Τηλ. Επικοινωνίας: 25510-30497 25510-30413
| ΦΕΚ Ίδρυσης: |
|---|
Αντικείμενα Έρευνας
Το Εργαστήριο Γενετικής Πληθυσμών και Εξέλιξης ιδρύθηκε με το ΦΕΚ 278 τ. Α’/19-11-2002, με το Προεδρικό Διάταγμα 326. Το Εργαστήριο συστεγάζεται και συνεργάζεται στενά με το Εργαστήριο Γονιδιωματικής Ποικιλότητας και Γενετικής Επιδημιολογίας, το οποίο ιδρύθηκε με το ΦΕΚ 1532 τ. Β’/21-07-2015. Στο Εργαστήριο μελετώνται βιολογικοί μηχανισμοί σε γενετικό και μοριακό επίπεδο σε δύο κύριους άξονες: τη βιοϊατρική έρευνα, με έμφαση σε σπάνιες και συχνές ανθρώπινες ασθένειες, και τη μελέτη της βιοποικιλότητας, μέσω χρήσης εργαλείων βιοπληροφορικής για την ανάλυση δεδομένων γενετικής ποικιλότητας σε επίπεδο οργανισμών και πληθυσμών (πληθυσμιακή γενετική). Στο πεδίο της βιοϊατρικής έρευνας, τα μέλη του Εργαστηρίου ασχολούνται με τη μελέτη και κατανόηση σε γενετικό και μοριακό επίπεδο μηχανισμών που οδηγούν στην εμφάνιση παθολογικών καταστάσεων στον άνθρωπο (ταυτοποίηση και διερεύνηση γενετικών παραλλαγών, μελέτη παραλλαγών άγνωστης/αβέβαιης κλινικής σημασίας, μελέτες έκφρασης γονιδίων που φέρουν παθογόνες/πιθανώς παθογόνες παραλλαγές), είτε σε σπάνιες κληρονομικές διαταραχές είτε σε πολυπαραγοντικά νοσήματα με γενετική βάση, τόσο με χρήση κλασικών όσο και προηγμένων τεχνολογιών ανάλυσης για την ανίχνευση γενετικών και μοριακών δεικτών. Ως αποτέλεσμα των μακροχρόνιων διεθνών συνεργασιών και χρηματοδοτήσεων παλαιότερων και νέων μελών του, το Εργαστήριο συντηρεί βιοτράπεζα δειγμάτων βιολογικού και γενετικού υλικού από παιδιατρικούς ασθενείς με σπάνιο νευροαναπτυξιακό φαινότυπο, καθώς και ασθενείς με σπάνια και κοινά πολυπαραγοντικά νοσήματα. Βασικό στοιχείο της προόδου της δουλειάς που επιτελείται στο Εργαστήριο είναι η συνεργασία με κλινικούς επιστήμονες. Στο πεδίο της βιοποικιλότητας, τα μέλη του Εργαστηρίου ασχολούνται με θέματα πληθυσμιακής και εξελικτικής γενετικής, την ανάπτυξη μοριακών, στατιστικών και βιοπληροφορικών εργαλείων για την έρευνα της γενετικής ποικιλομορφίας και τους μηχανισμούς προσαρμογής φυτικών ειδών σε επίπεδο γονιδιωμάτων. Επιπλέον, μέσω συνεργασιών και χρηματοδοτήσεων, έχει δημιουργηθεί τράπεζα δειγμάτων βιολογικού και γενετικού υλικού ενδημικών φυτικών ειδών της Βορείου Ελλάδας. Το Εργαστήριο υποστηρίζει τις εκπαιδευτικές ανάγκες σημαντικού αριθμού συναφών προπτυχιακών μαθημάτων, όπως «Εξελικτική Βιολογία», «Πληθυσμιακή και Εξελικτική Γενετική», «Γενετική Ι», «Εργαστηριακό Μάθημα ΙΙ: Βιοχημεία και Γενετική», «Μοριακή Βάση Γενετικών Νοσημάτων», «Μηχανισμοί Καρκινογένεσης», «Εργαστηριακή Γενετική», «Μοριακοί Μηχανισμοί Επιγενετικής», και άλλα, ενώ αποτελεί φορέα εκπόνησης ερευνητικών προγραμμάτων στο πεδίο της Πληθυσμιακής και Εξελικτικής Γενετικής. Μέλη ΔΕΠ του Εργαστηρίου συντονίζουν συναφή μαθήματα σε διαφορετικά ΠΜΣ του Τμήματος και διδάσκουν σε σημαντικό αριθμό μαθημάτων των προσφερόμενων ΠΜΣ. Στα ερευνητικά ενδιαφέροντα του εργαστηρίου περιλαμβάνονται: - Μελέτη της γενετικής ποικιλότητας οργανισμών και πληθυσμών, π.χ. μελέτες γενετικής συσχέτισης σε επίπεδο ολικού γονιδιώματος (GWAS), εξελικτική γενετική, - Μελέτη της γενετικής και μοριακής βάσης νοσημάτων του ανθρώπου (σπάνια κληρονομικά νοσήματα και πολυπαραγοντικές ασθένειες), - Βιοπληροφορική επεξεργασία και ανάλυση δεδομένων σε γονιδιωματική και μεταγραφωμική κλίμακα, - Γονιδιωματική της βιοποικιλότητας (εργαλεία έρευνας της γενετικής ποικιλομορφίας), - Πληθυσμιακή και εξελικτική γενετική φυτικών ειδών (πρότυπα γενετικής ποικιλότητας σε πληθυσμούς άγριων φυτών στον χώρο και στον χρόνο)
Μέλη Εργαστηρίου
| Ονοματεπώνυμο | Θέση/Ιδιότητα | Ιδρυματικό Email | Τηλ. Επικοινωνίας |
|---|---|---|---|
| Γεωργίτση Μαριάνθη | Επίκουρη Καθηγήτρια, Δ/ντρια Εργαστηρίου | mgeorgit@mbg.duth.gr | 25510-30497 25510-30413 |
Επιλεγμένα Ερευνητικά Προγράμματα
| Τίτλος Προγράμματος | Διάρκεια | Πλαίσιο Χρηματοδότησης |
|---|---|---|
| Odyssey: Connecting molecular and geographical biodiversity data | 2025-2028 | ESFRI Research Infrastructures and e-Infrastructure, ELIXIR Commissioned Services Project: 2024-SCIENCE-BFSP, HORIZON EUROPE |
| ΒΕΛΤΙΩΣΗ ΤΗΣ ΚΑΤΑΣΤΑΣΗΣ ΔΙΑΤΗΡΗΣΗΣ ΤΟΥ PINUS HELDREICHII ΣΕ ΕΘΝΙΚΟ ΕΠΙΠΕΔΟ ΜΕΣΩ ΠΑΡΑΔΟΣΙΑΚΩΝ (ΠΟΛΛΑΠΛΑΣΙΑΣΜΟ) ΚΑΙ ΚΑΙΝΟΤΟΜΩΝ ΜΕΘΟΔΩΝ (GENOTYPING) | 2023-2025 | Υπουργείο Περιβάλλοντος & Ενέργειας – Πράσινο Ταμείo |
| ECOeDNA – ΕΦΑΡΜΟΓΗ ΤΗΣ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑΣ eDNA ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΑΡΑΚΟΛΟΥΘΗΣΗ ΤΩΝ ΙΧΘΥΟΑΠΟΘΕΜΑΤΩΝ ΚΑΙ ΤΩΝ ΓΕΝΕΤΙΚΩΝ ΠΟΡΩΝ ΤΟΥ ΥΔΑΤΙΝΟΥ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΟΣ ΤΟΥ ΘΡΑΚΙΚΟΥ ΠΕΛΑΓΟΥΣ ΩΣ ΕΡΓΑΛΕΙΟ ΑΕΙΦΟΡΙΚΗΣ ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗΣ | 2023-2025 | Υπουργείο Περιβάλλοντος & Ενέργειας – Πράσινο Ταμείo |
| ELIXIR-GR: The Greek Research Infrastructure for Data Management and Analysis in Life Sciences | 2018-… | Εθνικός Οδικός Χάρτης Ερευνητικών Υποδομών, Επιχειρησιακό Πρόγραμμα «Ανταγωνιστικότητα, Επιχειρηματικότητα και Καινοτομία» (ΕΠΑΝΕΚ) - Ευρωπαϊκό Στρατηγικό Φόρουμ για τις Ερευνητικές Υποδομές (ESFRI) |
Επιλεγμένες Δημοσιεύσεις
| Χρονολογική Σειρά | APP | doi |
|---|---|---|
| Topaloudi A, ….., Georgitsi M*, Paschou P* (2022). A Myasthenia Gravis genome-wide association study implicates AGRN as a risk locus. J Med Genet 59(8):801-809. | 10.1136/jmedgenet-2021-107953 | |
| Topaloudi A, ….., Georgitsi M, Drineas P, Paschou P (2023). PheWAS and cross-disorder analysis reveal genetic architecture, pleiotropic loci and phenotypic correlations across 11 autoimmune disorders. Front Immunol 14: 1147573 | 10.3389/fimmu.2023.1147573 | |
| Tsetsos F, …..; PGC TS Working Group; TSAICG; TSGeneSEE Initiative; EMTICS Collaborative Group; TS-EUROTRAIN Network; TIC Genetics Collaborative Group; ….., Georgitsi M, Hoekstra PJ, Paschou P. (2024). Genome-wide Association Study points to novel locus for Gilles de la Tourette Syndrome. Biol Psychiatry 96(2):114-124 | 10.1016/j.biopsych.2023.01.023 |
Υποδομές και Εξοπλισμός
Ερευνητικές υποδομές ανοικτής πρόσβασης: DELL Servers, απεικονιστικό σύστημα με τράπεζα UV, συσκευές ηλεκτροφόρησης, θερμοκυκλοποιητής gradient, αυτοματοποιημένο σύστημα διαχείρισης υγρών, UV PCR cabinet, επιτραπέζιες φυγόκεντροι σταθερής και μεταβλητής γωνίας, μαγνητικοί αναδευτήρες, θερμομπλοκ, ζυγός ακριβείας, πεχάμετρο, ψυγεία, καταψύκτες και υπερκαταψύκτης -800C
Διπλώματα ευρεσιτεχνίας
Δεν υπάρχουν καταχωρημένα Διπλώματα ευρεσιτεχνίας.
Τεχνοβλαστοί
Δεν υπάρχουν καταχωρημένοι Τεχνοβλαστοί




